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植物应答DNA损伤的机理
植物应答 DNA 遗传信息
2023/12/28
DNA是遗传信息的载体，它的准确复制和传递是生物的生存基础。但是DNA不断地受到各种外源和内源因素的损伤。如果这些损伤不能被修复，就会影响复制、转录等生物学过程，进而影响生物的生长发育和物种繁衍。为了维持基因组的稳定性，生物进化了复杂而精细的DNA损伤应答机制，包括暂停细胞周期、修复DNA损伤等关键环节。我将汇报SMC5/6复合体、蛋白激酶WEE1以及三个新蛋白调控植物DNA损伤应答的机理。
国家植物标本资源库精准采集项目助力“中国植物DNA库”建设（图）
植物标本 资源库 植物DNA库
2023/9/19
我国是世界上植物多样性最丰富的国家之一，高等植物种类约4.6万种（含种下等级），也是世界上重要的作物起源中心之一。其中的许多珍稀濒危物种、重要经济植物野生种群和近缘物种等战略生物资源，具有不可替代的生态、经济、文化等价值。为构建中国特色的生物多样性保护体系、独立自主的种业工程、完善的生物安全机制，寻找和开发高效碳汇植物等，必须建立物种精准鉴定体系，这离不开植物物种信息和遗传数据参考序列库的支持。
中国科学院昆明植物研究所在DNA甲基化调控竹笋快速生长研究中获进展（图）
DNA甲基化 调控 竹笋快速生长
2022/8/31
竹类植物作为一种特殊的禾草，其笋期的快速生长这一特殊性状备受关注，但以往研究集中在细胞微观结构、转录组、代谢组、蛋白质组、小RNA以及新基因等方面。DNA甲基化作为重要的表观遗传修饰，主要参与转座子沉默和基因的表达调控，在植物生长发育中发挥重要的调控作用。然而，目前尚不清楚DNA甲基化是否影响竹笋的快速生长。
竹类植物作为一种特殊的禾草，其笋期的快速生长这一特殊性状备受关注，但以往的研究主要集中在细胞微观结构、转录组、代谢组、蛋白质组、小RNA以及新基因等方面。DNA甲基化作为一种重要的表观遗传修饰，主要参与转座子沉默和基因的表达调控，在植物生长发育中发挥着重要的调控作用。然而，目前尚不清楚DNA甲基化是否影响竹笋的快速生长。
华中农业大学在植物DNA损伤应答领域取得新进展（图）
植物DNA损伤 遗传信息
2022/11/27
所有生物都需要把正确的遗传信息（DNA）传递给下一代，但是DNA 不断地受到各种内源和外源因素的损伤。为了维持基因组稳定性，生物进化出复杂而精细的DNA损伤应答机制。在所有DNA损伤类型中，DNA双链断裂是最严重的DNA损伤形式。同源重组修复（HR）是精准修复DNA双链断裂的主要机制，也是利用基因组编辑工具进行基因打靶的基础。
浙江大学植物研究所周明课题组在Nature Commun.发文合作揭示植物组织特异性DNA甲基化模式产生的遗传基础（图）
浙江大学植物研究所 周明 Nature Commun DNA甲基化 植物组织特异性 遗传基础
2022/5/31
近日植物所周明课题组和美国Salk生物研究所Julie Law课题组合作完成的题为The CLASSY family controls tissue-specific DNA methylation patterns in Arabidopsis的研究论文，发表在Nature Communications。一个成熟的个体拥有同一套基因组，却能发育成不同类型的细胞、组织和器官，表观遗传修饰模式被认为...
2022年1月13日植物所周明课题组和美国Salk生物研究所Julie Law课题组合作完成的题为The CLASSY family controls tissue-specific DNA methylation patterns in Arabidopsis的研究论文，发表在Nature Communications。
正确修复受损DNA对基因组完整性和个体发育至关重要。作为半自主细胞器，植物的质体必须通过一系列机制来维持自身基因组完整。清华大学孙前文实验室的最新研究发现RNA:DNA hybrids结构协助拟南芥叶绿体基因组DNA双链断裂修复的全新分子机制，证实RNA:DNA hybrids在促进同源重组修复和叶绿体细胞器发育过程中的积极作用，揭示了RNase H1蛋白AtRNH1C与单链DNA结合蛋白WHY1...
2020年12月7日至11日，首届“植物DNA条形码2.0与系统发育基因组学”研讨培训班在云南昆明成功举办。来自中国科学院植物研究所、昆明植物研究所、华南植物园、武汉植物园、西双版纳热带植物园、新疆生态与地理研究所，以及华东师范大学、北京师范大学、南方医科大学、成都中医药大学和广州中医药大学等全国22个省（直辖市、自治区）54家科研院所、高校和公司的200余位代表参加了研讨和培训。
中国科学院武汉植物园在DNA甲基化研究中取得新进展（图）
中国科学院武汉植物园 DNA甲基化 基因表达
2020/11/24
在生物体中，小分子RNA介导的DNA甲基化(RNA-directed DNA methylation,RdDM)过程主要发生在细胞核内，通过小RNA介导相同DNA序列发生重头甲基化（de novo methylation），与基因组水平的序列特异性改变有关，并引起转录水平的基因沉默。在植物中，DNA甲基化参与转座子沉默，特定基因表达调控以及参与植物生长发育调控等过程。其中转座子序列的活跃事件对植物...
2020年6月8日，Nature Plants期刊在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心朱健康研究组题为“Epigenetic memory marks determine epiallele stability at loci targeted by de novo DNA methylation”的研究论文。该研究首次发现DNA从头甲基化的改变也能稳定遗传的现象，并阐明了DNA甲基化和组...
研究证实“垃圾DNA”参与数量性状精细调控
垃圾DNA 数量性状 精细调控
2020/4/30
2020年4月25日，美国《公共科学图书馆—遗传学》在线发表了华中农业大学教授张祖新课题组最新研究成果。他们揭示了一个基因间区KRN4作为增强子远程顺式调控靶基因UNBRANCHED3（以下简称UB3）表达和穗行数数量变异。论文通讯作者张祖新介绍，植物基因组含有大量的基因间区。早期研究认为这些基因间区是无生物功能的“垃圾DNA”。随着越来越多的植物基因组测序完成，解析基因间区的功能成为一大挑战。基...
转基因表达的稳定性在种苗商业化生产中具有重要作用，然而基因沉默现象影响着这种稳定性的产生与维持。中国科学院华南植物园区永祥研究团队长期致力于多基因定点叠加技术的研发以加快分子育种进程。要获得定点叠加的多基因材料并非易事，在烟草中的实验结果表明，其效率约为5%，可是在这些留下的材料中，却有1/3存在转基因沉默现象，无法正常使用（Hou et al., 2014 Molecular Plant 7:1...
2017年5月15日，《美国科学院院刊》（PNAS）在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物逆境生物学研究中心朱健康研究组和郎曌博研究组题为Critical roles of DNA demethylation in the activation of ripening-induced genes and inhibition of ripening-repressed genes in tom...
依据科技部《科学技术评价办法》的有关规定，中科合创（北京）科技成果评价中心（第三方专业科技成果评价机构）按照科技成果评价的标准及程序，本着科学、独立、客观、公正的原则，昆明植物研究所于2017年5月5日组织了来自云南省林业科学院、西南林业大学、云南大学、中国科学院昆明动物研究所、中国科学院西双版纳热带植物园、云南省对外科技合作协会的七位专家对由李德铢研究员组织完成的“中国植物DNA条形码研究” 科...