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中国科学院科学家研发出基因编辑动物新发突变数据库（图）
基因编辑 动物 数据
2024/11/9
基因编辑动物在生物科学和医学研究中发挥着重要作用，在农业领域展现出实际应用潜力。随着基因编辑技术的发展，基因编辑动物的数量快速增长。学界越来越关注基因编辑系统对生物基因组的影响以及基因编辑动物可能出现的新发突变问题。目前，关于基因编辑动物数据的整理、汇总及标准化分析相对缺乏，限制了研究人员挖掘和利用这些数据。
已知N-乙酰基转移酶基因NAT2调控人类2型糖尿病的胰岛素敏感性，但其中的机制并不清楚。近来hNAT2被发现能够乙酰化内源性的天然多胺，包括腐胺和亚精胺。亚精胺一直以来被认为具有抗炎、抗衰老的保健作用，可以预防各种与衰老相关的疾病，包括保护心血管系统、神经系统，维持肠道屏障完整性以及延长寿命，但对其中分子机制也一直不清楚。2024年11月7日，中国科学院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心袁钧...
中国科学院北京基因组所等开发基于深度学习模型的空间转录组精细分辨率细胞注释算法（图）
基因 模型 空间 细胞
2024/11/7
细胞在组织和器官内的空间位置与其功能相关。新兴的空间转录组技术能够在组织中原位捕获转录信息，为解析基因表达谱从而解码细胞空间分布、破译组织的空间结构、探讨复杂的生物学功能提供了条件。
基因编辑动物在生物科学和医学研究中发挥着至关重要的作用，并且在农业领域展现出巨大的实际应用潜力。近2024年来，随着基因编辑技术突飞猛进的发展，基因编辑动物的数量在过去十年间获得了急速的增长。基因编辑系统在全基因组水平上对DNA序列的影响，以及基因编辑动物中可能出现的脱靶新发突变是人们普遍关注的问题。然而，目前仍然缺乏对基因编辑动物数据的整理、汇总以及标准化分析，限制了研究人员深入挖掘和利用这些数...
中国科学院北京基因组研究所国家生物信息中心合作研发基因编辑动物新发突变数据库VDGE（图）
基因 编辑 数据
2024/11/7
基因编辑动物在生物科学和医学研究中发挥着至关重要的作用，并且在农业领域展现出巨大的实际应用潜力。随着基因编辑技术的迅猛发展，基因编辑动物的数量在过去十年间急速增长。科学界越来越关注基因编辑系统对生物基因组的影响及基因编辑动物中可能出现的新发突变问题。然而，目前仍然缺乏对基因编辑动物数据的整理、汇总以及标准化分析，限制了研究人员深入挖掘和利用这些数据。
2024年11月3日，中国科学院上海营养与健康研究所王跃祥团队、华大基因智惠医学研究院吴逵团队和上海交通大学附属仁济医院曹晖团队在Nature Communications在线发表了题为Genomic and Transcriptomic Landscape of Human Gastrointestinal Stromal Tumors的研究论文。该研究提供了胃肠间质瘤基因组和转录组全景图，提出...
中国科学院植物所张梅研究组揭示调控玉米雄穗发育关键因子phasiRNA产生的新机制（图）
张梅 发育 基因 分离
2024/11/6
植物phasiRNA是一类具有相位分布的次级小RNA，在玉米雄穗发育过程中具有重要作用，其产生途径中关键基因的突变均影响花药的正常发育。2024年10月31日研究表明，24-nt phasiRNA前体（24-PHAS）在玉米幼嫩雄穗中分离的膜结合多聚核糖体上富集，但核糖体的结合模式及其在24-nt phasiRNA产生途径中的作用仍不清楚。
寒害会严重影响水稻的生产，通过挖掘信号途径核心基因模块，利用分子设计技术培育寒害韧性的品种是重要的解决方案之一。第二信使是介导信号途径的核心上游组分，直接响应低温感受器信号。已有研究发现，低温感受器大多触发钙离子作为第二信使的信号途径，其它分子作为第二信使信号途径罕有报导。
中国科学院动物所揭示槟榔黄化病关键病原及传播方式
动物 基因
2024/11/1
2024年10月30日，中国科学院院士康乐与动物研究所研究员张晓明团队，在《科学通报》（Science Bulletin）上发表了题为The phytoplasma (Candidatus Phytoplasma arecae) is the crucial pathogen to cause areca palm yellow leaf disease的研究论文。该研究确认了槟榔黄化植原体是海南...
中国科学院动物研究所康乐院士团队揭晓槟榔黄化病关键病原及传播方式（图）
基因 检测
2024/11/6
槟榔种植业是槟榔产业的最前端和基础。近2024年来，海南槟榔黄化病的发生造成槟榔大面积减产、绝收甚至死亡，严重威胁槟榔产业的健康发展。多年来，海南槟榔黄化病病原不清、检测手段缺失以及传播途径未知造成了针对性防控手段的缺失，使海南槟榔黄化病无法得到有效控制。
中国科学院动物研究所合作揭示青藏高原及其周边分布裂腹鱼的多倍化演化历史（图）
青藏高原 演化 历史 基因
2024/11/6
多倍化或全基因组重复在生物多样性演化中扮演重要角色，然而也有研究认为多倍化是生物演化的随机事件。回答多倍化是否为适应性演化的结果亦或随机事件，关键在于理解多倍体类群建立和形成的过程。中国科学院动物研究所联合中国科学院水生生物研究所团队，以青藏高原及其周边地区分布的裂腹鱼为研究对象，整合了包括裂腹鱼三个不同类群67个物种及21个近缘二倍体物种的组学数据，通过对18种裂腹鱼两两间226至 1684 个...
中国科学院植物所王印政研究组揭示大岩桐属套筒花重复发生的分子遗传机制（图）
王印政 分子遗传 基因
2024/11/6
重瓣花根据来源主要可划分为两种类型：一是雌雄蕊瓣化的重瓣花，其特点是花瓣数量众多，如牡丹、芍药、月季等；二是花萼瓣化的重瓣花，其特点是各轮花器官数目均正常，仅花萼发生瓣化，如百合、郁金香等。根据花器官身份决定的ABC模型，雌雄蕊瓣化重瓣花的产生通常与C类基因的下调以及A类基因的上调有关，而花萼瓣化重瓣花的产生多与B类基因的上调有关。套筒花因具有两轮花冠筒而得名，是一类比较特殊的花萼瓣化重瓣花。与雌...
中国科学院南京土壤所等关于冬季变暖对作物生物量碳影响的研究获进展（图）
土壤 地球 蛋白质
2024/10/18
中国科学院南京土壤研究所研究员梁玉婷课题组联合中国科学院地球环境研究所、瑞士苏黎世联邦理工学院、美国俄克拉荷马大学等国内外研究单位的科研人员，在冬季变暖对作物生物量碳影响的研究方面取得了进展。相关研究成果以Effects of winter soil warming on crop biomass carbon loss from organic matter degradation为题，在线发表...
中国科大发展出蛋白质主链去噪扩散概率模型（图）
蛋白质 模型 预测
2024/10/19
中国科学技术大学教授刘海燕与陈泉团队开发了不依赖于预训练结构预测网络的蛋白质主链去噪扩散概率模型SCUBA-D（SCUBA-diffusion）。SCUBA-D可自动从头设计主链结构或指定功能位点生成主链结构。大量实验结果验证了SCUBA-D的设计成功率和设计精度。2024年10月9日，相关研究成果以De novo protein design with a denoising diffusion...
中国科大发现编码p53蛋白突变促进肿瘤免疫逃逸机制（图）
蛋白 肿瘤 免疫
2024/10/16
抑癌基因TP53（编码p53蛋白）通常发挥肿瘤监查的作用。TP53基因突变后转变为癌基因，是多种肿瘤发生发展的驱动因素之一。中国科学技术大学生命科学与医学部免疫调节与免疫治疗重点实验室教授魏海明课题组发现，p53可以直接调控免疫细胞的发育、分化与功能，并在肿瘤免疫微环境中发挥重要作用。p53突变导致肿瘤干细胞分泌白细胞介素34，而白细胞介素34进一步代谢重编程肿瘤相关巨噬细胞，并抑制CD8T细胞的...